Typizace Streptococcus pneumoniae z klinického materiálu
Typizace Streptococcus pneumoniae z klinického materiálu je prováděna metodou multiplex (PCR). Takto lze určit 17 sérotypů (1, 3, 4, 8, 10A, 14, 16F, 17F, 19F, 19A, 20, 23F, 23A, 23B, 31, 34, 35B) a 15 skupin sérotypů či séroskupin, které obsahují celkem 37 sérotypů (6A/B/C/D, 6C/D, 7F/A, 9N/L, 9V/A, 11A/D, 12F/A/44/46, 15A/F, 15B/C, 18A/B/C/F, 22F/A, 24A/B/F, 25F/A/38, 33F/A/37, 35F/47F). Celkem lze touto metodou testovat 57 sérotypů z celkových aktuálně známých 106 sérotypů [web pneumogen.net].
Nevýhodou této metody je, že ne každý sérotyp má své vlastní primery. Pokud určíme skupinu sérotypů či séroskupinu, nelze již dále dourčit, o jaký sérotyp se jedná. Další nevýhodou této metody je, že koncentrace DNA v testovaném materiálu nemusí být dostatečná. V takovém případě často pouze určíme, že se jedná o S. pneumoniae pomocí ověření přítomnosti genu cpsA, protože k tomu je třeba menší množství DNA než k samotné typizaci.
Z výše zmíněných důvodů je preferováno, když je k sérotypizaci zaslána bakteriální kultura, pokud je to možné.